Sesuai dengan Visi Kabupaten Karimun yaitu Terwujudnya Kabupaten Karimun Sebagai Pusat Pertumbuhan Ekonomi Berkeadilan Berlandaskan Iman dan Taqwa , untuk itu Badan Pendapatan Daerah mempunyai peran  dan tanggung jawab yang sangat besar demi mensukseskan pertumbuhan ekonomi di Kabupaten Karimun. Sebagai Badan yang diberikan tugas pokok untuk melaksanakan urusan rumah tangga Kabupaten Karimun dalam bidang pendapatan. Badan Pendapatan Daerah terus berusaha semaksimal mungkin menggali potensi daerah yang ada khususnya pada penerimaan pajak dan retribusi daerah yang pada tujuan akhirnya adalah untuk meningkatkan Pendapatan Asli Daerah ( PAD ).

Misi Kabupaten Karimun yang berkaitan dengan Badan Pendapatan Daerah kab.Karimun adalah :
Misi 1                        :  Meningkatkan Perekonomian Daerah  yang Mandiri Berbasis Sumber Daya    dan Kearifan Lokal.
Tujuan Misi 1        :  Meningkatkan Pertumbuhn Ekonomi Kemandirian Daerah.
Dengan sasaran   :  Meningkatnya Kontribusi Pendapatan Asli Daerah.

Misi 5                        :   Mewujudkan Birolrasi Yang Profesional dan Unggul
Tujuan Misi 5        :  Meningkatakan Tata Kelola Pemerintah Yang Baik (Good Governance )
Dengan sasaran   :  Meningkatkan Kualitas Pelayanan Publik